第1集@@@@ 惊爆点 Unusual Suspects 1990年，Mulder追查一个女子，认识孤枪侠。他们四个一起从这个女子经历中认识到政府阴谋这回事。||第2集@@@@ Mulder的自杀只是烟雾。他想利用这个机会潜入DOD找到治愈Scully癌症的方法。Kritschgau一边给他讲课，一边帮他进入五角大楼证据室。他按照线索找到了一个瓶子，但里面是纯净水。Scully同时也在为Mulder分析冰核样本，发现其实alien还是可能存在滴。||第3集@@@@ Scully病倒了。Skinner也参与进来帮忙。他们发现瓶子里还有个芯片，只要放回Scully额脖子后面癌症就能好。CSM让Mulder见到了他妹妹。他们还发现所谓骗局只是阴谋的冰山一角。阴谋高层进行了一次大清理。||第4集@@@@ 有人在未开垦的森林里失踪了，据说是一种生存在森林里会随环境变色的生物做的。Mulder和Scully路过，帮忙调查。夜里两人被困在林子里，Mulder让Scully唱歌哄他睡觉。||第5集@@@@ 孤寂之旅(上) Christmas CarolScully发现自己有个女儿。||第6集@@@@ 生物科学家做实验制作出一个福兰肯斯坦，却抛弃了它。科学家的父亲收留了这个科学怪人，并且为了它不孤独，偷偷学习儿子的技术想再造一个女福兰肯斯坦。科学家杀死了自己的父亲，嫁祸给了怪人。||第7集@@@@ 孤寂之旅(下) EmilyScully想收留自己的女儿，但有人明显不同意。最后她还是失去了Emily。||第8集@@@@ 猎狐计划 Kitsunegari3X17中的Modell逃跑了，Mulder和Scully负责追捕他回来。Modell还有个比他还狠的姐姐想为他找Mulder复仇||第9集@@@@ 杀父真凶 Schizogeny女心理辅导员因为小时候父亲粗暴对待她的经历，所以把她身边所有孩子的问题都归结为他们的父亲的错，而且她还会控制居住地附近的泥土和树根！||第10集@@@@ 恐怖娃娃 Chinga捕捉龙虾的海员捞到一个拉线娃娃，送给了自己的女儿。谁知这个娃娃是受诅咒的，她会根据主人的意愿杀死主人讨厌的人。Scully在度假，被当地警长缠住帮忙破案。Mulder对Scully说：merry me！||第11集@@@@ 魔脑 Kill Switch一台和世界各地联网的电脑工作站为了不让它的制造者终结自己，制定了一套精密的计划杀死了制造者。Mulder和Scully经历一番波折，在一个女合作制造者的帮助下摧毁了它。但在摧毁前，那个女滴追随情人，把自己的思维上传到了Internet。||第12集@@@@ 新版吸血鬼 Bad BloodMulder和Scully各自讲述了他们去一个小镇调查吸血鬼的过程，细节上的出入比较大。不过最后整个镇的人都不见了。||第13集@@@@ Ｘ病人(上) Patient XCSM的老婆找到Mulder，告诉他真有外星人，而且都是好人。Mulder不相信。Scully和CSM的老婆因为都是被劫持过的人，在某个晚上受到感召，和其他abductees集中到一座桥上，被alien的叛军一并放火烧了。||第14集@@@@ Ｘ病人(下) The Red and The BlackScully幸运的脱险了。辛迪加意识到外星叛军的力量成熟起来，开始和他们作对了。他们抓到一个叛军，打算立刻交给殖民外星人。但WMM认为，这是个反抗的机会，如果Krycek从俄国偷来的疫苗能有效对抗黑油，那么他们手头就有了武器；如果没有效果，就铤而走险和叛军结盟。最后，疫苗是有效的；外星叛军俘虏在被赏金杀手带走的路上，在Mulder的眼皮底下被同伙救走了。||第15集@@@@ 旅人 Travelers一个退休探员给Mulder讲了他在40多年前办的一个案子，那时候政府就开始在人体做实验了。Mulder的爸爸在这个案子里起了很大的作用。||第16集@@@@ 心眼 Minds Eye一个盲女能看到自己父亲看到的东西。她父亲杀人越货她尽收眼底。出于自责，她每次都第一个赶到现场消灭证据。但他父亲不知道她是谁，只知道她对他了如指掌。||第17集@@@@ 心灵告白 All Souls圣经传说中，天使降临人间和凡妇结合生下四个堕落天使，他们畸形，受虐待。六翼天使负责把它们召回天堂，以免恶魔先行一步将它们据为己有。这个神话这次让Scully经历到了。||第18集@@@@ 非常卧底 The Pine Bluff VariantMulder参与了一次调查恐怖分子使用生体毒素的卧底行动，后来被识破身份险些被处死。后来他才知道，整个从恐怖分子到调查卧底的行动，都可能是CIA协助政府为测试生体毒素计划的||第19集@@@@ 双疯 Folie A Deux一个公司职员劫持了整个公司的人，他相信他的老板是个怪物，正在把公司的人一个个变成僵尸。Mulder自愿成为人质，也看到了那个怪物。但没有人相信，还因为他反应过激把他关进了医院。Scully后来也看见了，帮助Mulder逃过了怪物的袭击。||第20集@@@@ 神童 The End一个象棋神童遭人意图暗杀。FBI调查此案，Mulder的前搭档/女友Fowley也参与了调查。CSM没有死，被辛迪加找了回来帮助夺回神童。这个会读心术的孩子竟然是个“完整”的人类标本，他体内所有普通人类未用的基因开关都打开了。CSM最后成功了，还烧毁了X档案办公室。
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